股权转让价格的确定方法如下：
将股东出资时所确认的股权价格作为转让价格。
以公司净资产额为标准确定股权转让价格。
以审计、评估的价格作为转让价格。
将拍卖、变卖价作为转让价格。另外，也有采用其他方法来确定转让价格的。
一、股权转让有未分配利润要交税吗？
股权转让有未分配利润要交税。根据《中华人民共和国公司法》规定，公司拥有的财产权。未分配利润属于公司财产的一部分，属于公司所有。股东在转让股权时，也转让了权对应的股东转让给公司的财产权益、管理权利和义务。也就是说，股权转让价格应包括未分配利润的对价，不能单独计算。根据公司章程，合格股东作出决议，在股权转让前实施利润分配，股东获得股息，公司资产价值相应降低，股权转让价格相应降低。
二、全民所有制企业合并的流程
全民所有制企业的合并流程：
1、初步确定被合并方和合并方企业；
2、清算产权验资和财务审计；
3、资产评估；
4、确定产权低价；
5、签订合并协议和转让价格管理。
公司合并可以采取吸收合并或者新设合并。一个公司吸收其他公司为吸收合并，被吸收的公司解散。
三、股权转让的个人所得税的计算依据
自然人转让所投资企业股权(份)(以下简称股权转让)取得所得，按照公平交易价格计算并确定计税依据。计税依据明显偏低且无正当理由的，主管税务机关可采用本公告列举的方法核定。二、计税依据明显偏低且无正当理由的判定方法
(一)符合下列情形之一且无正当理由的，可视为计税依据明显偏低：
1.申报的股权转让价格低于初始投资成本或低于取得该股权所支付的价款及相关税费的;
2.申报的股权转让价格低于对应的净资产份额的;
3.申报的股权转让价格低于相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权转让价格的;
4.申报的股权转让价格低于相同或类似条件下同类行业的企业股权转让价格的;
5.经主管税务机关认定的其他情形。
【本文关联的相关法律依据】
《公司法》第七十一条，有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。
股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。