水利建设专项收入报税的流程如下：
1、方面：水利建设专项收入一般属于免税项目，因此不需要缴纳。但如果收入中包含应税项目的部分，需要按照规定缴纳；
2、企业所得税方面：水利建设专项收入属于企业经营所得，需要缴纳企业所得税。企业应根据水利建设专项收入的具体情况计算应纳税所得额和应纳税额，按照规定申报纳税申报表并缴纳企业所得税；
3、印花税方面：水利建设专项收入一般不需要缴纳印花税。但如果收入中包含应纳印花税的部分，需要按照规定缴纳印花税。
水利建设专项收入报税的材料：
1、企业或个人的税务登记证明和身份证明；
2、水利建设专项收入的来源证明，例如补贴凭证、水利建设基金收据或等；
3、水利建设专项收入的计算方法和计算依据，例如税收优惠的具体规定、水利建设项目的实际投入和预算等；
4、企业或个人的收入证明，例如收据、、合同等；
5、相关财务报表和会计凭证，例如资产负债表、利润表、现金流量表、凭证等；
6、其他相关证明和材料，例如税务机关要求提供的其他证明材料等。
综上所述，不同地区的税收可能存在差异，企业应当根据当地的具体税收和相关法律法规进行报税。
【法律依据】：
《中华人民共和国企业所得税法》第一条
在中华人民共和国境内，企业和其他取得收入的组织（以下统称企业）为企业所得税的纳税人，依照本法的规定缴纳企业所得税。
个人独资企业、合伙企业不适用本法。