【法律分析】
第一：计算方法不同
对于小规模纳税人来说，其应纳额等于不含税销售额乘以征收率。
对于一般纳税人来说，其应纳额等于不含税销售额乘以税率，再减掉进项税额。
即小规模纳税人不允许抵扣进项税额，而一般纳税人则允许抵扣。而关于一般纳税人抵扣进项，必须是以取得的专用、海关专用缴款书或农产品采购这类“专用”为抵扣依据，取得普通的不准许抵扣进项，注意小规模纳税人即使取得了专用，也不允许抵扣进项。
第二：适用的税率或征收率不同
小规模纳税人适用的征收率比一般纳税人在一般计税办法下适用的税率要低，现行小规模纳税人征收率有3%和5%两档，一般纳税人在一般计税办法下适用的税率现阶段有三档，分别是13%，9%和6%。但是应当注意，选择低税率的小规模纳税人，虽然税率低，但不意味着税负低，这和销售额与购进额的大小都有关系。
第三：纳税申报周期不同
一般纳税人的纳税申报是以月为周期，而小规模纳税人可以选择按照月周期申报或者按照季度申报。
【法律依据】
《中华人民共和国暂行条例》
（三）纳税人销售交通运输、邮政、基础电信、建筑、不动产租赁服务，销售不动产，转让土地使用权，销售或者进口下列货物，税率为11%：
1.粮食等农产品、食用植物油、食用盐；
2.自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、二甲醚、沼气、居民用煤炭制品；
3.图书、报纸、杂志、音像制品、电子出版物；
4.饲料、化肥、农药、农机、农膜；
5.规定的其他货物。