包庇毒品犯罪分子罪的立案标准为：
（一）行为人作虚明，帮助掩盖罪行的；
（二）帮助隐藏、转移或者毁灭证据的；
（三）帮助取得虚假身份或者身份证件的；
（四）以其他方式包庇犯罪分子的。
【法律依据】
《最高人民、关于机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（三）》第三条
包庇走私、贩卖、运输、制造毒品的犯罪分子，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：
（一）作虚明，帮助掩盖罪行的；
（二）帮助隐藏、转移或者毁灭证据的；
（三）帮助取得虚假身份或者身份证件的；
（四）以其他方式包庇犯罪分子的。
实施前款规定的行为，事先通谋的，以走私、贩卖、运输、制造毒品罪的共犯立案追诉。