员工差旅费是企业为员工出差而支付的费用，企业可以按照国家规定的税务，将差旅费作为进项税额进行抵扣。具体方法如下：
1、确认差旅费是否符合抵扣条件：根据国家税务总局的规定，差旅费必须是按照国家规定的标准报销，且不超过国家规定的标准，才能作为进项税额进行抵扣。因此，企业需要核实差旅费的报销标准和规定，确认差旅费是否符合抵扣条件；
2、获取差旅费的：企业在支付差旅费时，需要向供应商索取正规的，包括专用或者普通。差旅费的上需要注明差旅费的具体内容、金额、税率、税额等信息；
3、填写进项税额申报表：企业在申报进项税额时，需要将差旅费的信息填写在进项税额申报表中，包括号码、开票日期、开票金额、税率、税额等信息；
4、抵扣进项税额：企业在申报时，可以将差旅费的税额作为进项税额进行抵扣，减少应纳额。企业需要根据实际情况和税务规定，正确申报和抵扣进项税额。
员工差旅费进项税额抵扣的一般流程：
1、保存票据：企业需要让员工在差旅费用产生时，保存好相关的票据，如机票、酒店、餐饮等；
2、进项税额计算：企业需要根据保存的票据，计算出员工差旅费的进项税额；
3、缴纳税款：企业需要按照规定，将员工差旅费的进项税额和其他进项税额一起纳税；
4、抵扣进项税额：企业在纳税时，可以将员工差旅费的进项税额与销售额的相抵扣，以减少企业需要缴纳的税额。
综上所述，员工差旅费进项税额抵扣的流程需要遵守相关的税收和法律法规，企业需要在规定的时间内申报纳税并按时缴纳税款。
【法律依据】
《中华人民共和国暂行条例》第
纳税人购进货物、劳务、服务、无形资产、不动产支付或者负担的额，为进项税额。
下列进项税额准予从销项税额中抵扣：
（一）从销售方取得的专用上注明的额；
（二）从海关取得的海关进口专用缴款书上注明的额；
（三）购进农产品，除取得专用或者海关进口专用缴款书外，按照农产品收购或者销售上注明的农产品买价和11%的扣除率计算的进项税额，另有规定的除外；
（四）自境外单位或者个人购进劳务、服务、无形资产或者境内的不动产，从税务机关或者扣缴义务人取得的代扣代缴税款的完税凭证上注明的额。准予抵扣的项目和扣除率的调整，由决定。