海关进口专用缴款书抵扣方法：
1、取得海关缴款书信息；
2、稽查比对。确认平台查询到的海关缴款书信息与实际情况是否一致；
3、稽核比对相符后，申请办理抵扣手续。
海关进口的和关税做记账凭证如下：
1、不能抵扣的，应把全部税费计入进货总成本，
（1）借：库存商品（支付购入商品总含税价，包括是1.09 关税是110.08）；
（2）贷：银行存款（总额支付数）。
2、其他进出口免费货物按海关其在国内的价值征收关税和的金额同样：
（1）借：库存商品 ；
（2）贷：银行存。
3、其他进出口免费货物指的是不用支付外汇货款，该进口货物是别人赠送的货物或者样品。进口还是要交关税和，那是因为虽然客户不要求支付货款，将其免费赠送，但是货物本身是存在价值的。而该产品的进口必然会对国内同类产品产生潜在威胁，因此海关还是会按照其在国内的价值（一般会适当降低）征收关税和的。
综上所述，在进行进口抵扣时需要带齐相应材料，并且要按照相关程序进行申报。
【法律依据】：
《国家税务总局关于管理等有关事项的公告》第二条
一般纳税人取得海关进口专用缴款书（以下简称“海关缴款书”）后如需申报抵扣或出口退税，按以下方式处理：
（一）一般纳税人取得仅注明一个缴款单位信息的海关缴款书，应当登录本省（区、市）选择确认平台（以下简称“选择确认平台”）查询、选择用于申报抵扣或出口退税的海关缴款书信息。通过选择确认平台查询到的海关缴款书信息与实际情况不一致或未查询到对应信息的，应当上传海关缴款书信息，经系统稽核比对相符后，纳税人登录选择确认平台查询、选择用于申报抵扣或出口退税的海关缴款书信息。
（二）一般纳税人取得注明两个缴款单位信息的海关缴款书，应当上传海关缴款书信息，经系统稽核比对相符后，纳税人登录选择确认平台查询、选择用于申报抵扣或出口退税的海关缴款书信息。