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专利名称：一种家犬全基因组低密度品种鉴定专用SNP芯片设
计方法
专利类型：发明专利
发明人：罗晗,刘星彤,白冰,林书弘申请号：CN201810469731.9申请日：20180516公开号：CN1082568A公开日：20181012
摘要：本发明公开了一种家犬全基因组低密度品种鉴定专用SNP芯片设计方法，包括：S1：从犬只基因库中，选取样本数量大于5的品系，从而获得包含有对应犬只品系的SNP分子库；S2：用PLINK软件滑动窗口程序，并结合设定的方差膨胀因子以及阶层式分群法，从所得SNP分子库中选取家犬品种高鉴别率的SNP标记分子位点；S3：再以S2中选出的SNP标记分子位点为SNP芯片设计模型设计SNP探针，并制成家犬品种鉴定专用的低密度SNP芯片。依据本发明所述设计方法设计的家犬品种鉴定专用的SNP芯片，在满足分类精度的前提下，筛选出品种分类所需要最小数据集，并根据该数据集开发一款专用于家犬品种鉴定低成本且高效的SNP芯片。
申请人：罗晗
地址：610041 四川省成都市武侯区一环路南一段24号附126211号
国籍：CN
代理机构：四川力久律师事务所
代理人：陈明龙
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