专用认证抵扣期限是在开具之日起180日内到税务机关办理认证。认证通过后，非纳税辅导期管理的一般纳税人，应在认证通过的次月申报期内，向主管税务机关申报抵扣进项税额;纳税辅导期管理的一般纳税人，应当在交叉稽核比对无误后，方可抵扣进项税额。一般纳税人发生真实交易但由于客观原因造成专用、海关进口专用缴款书等扣税凭证逾期的，经主管税务机关审核、逐级上报，由国家税务总局认证、稽核比对后，对比对相符的扣税凭证，允许纳税人继续抵扣其进项税额。一般纳税人由于除客观原因以外的其他原因造成扣税凭证逾期的，逾期未认证或申请比对的，其进项税额不予抵扣。一般纳税人取得的专用、海关进口专用缴款书等扣税凭证已认证或已采集上报信息但未按照规定期限申报抵扣;实行纳税辅导期管理的一般纳税人取得的扣税凭证稽核比对结果相符但未按规定期限申报抵扣，属于发生真实交易且符合规定的客观原因的，经主管税务机关审核，允许纳税人继续申报抵扣其进项税额。一般纳税人除客观原因规定以外的其他原因造成扣税凭证未按期申报抵扣的，其进项税额不予抵扣。
法律依据：
《中华人民共和国管理办法》 第二十七条 开具的单位和个人应当建立使用登记制度，设置登记簿，并定期向主管税务机关报告使用情况。