农村宅基地纠纷调解程序包括向提出申请，双方出示证据，工作人员调查取证，组织调解并制作调解书。如果调解不成功，土地管理部门将提出处理意见。根据《土地管理法》，宅基地纠纷可通过协商、行政或司法解决。同时，人民调解也是解决纠纷的一种方式，通过调解委员会促进当事人达成自愿协议。先进行调解，不能成功再进行起诉。
法律分析
先进行调解，不能成功再进行起诉。
农村宅基地纠纷调解程序:
1、向县级以上土地管理部门或者乡级提出书面申请;
2、双方当事人出示举证的材料和依据;
3、工作人员现场调查材料和取证;
4、组织双方当事人进行调解，制作书面调解书;
5、调解未达成协议的，或者调节书送达前一方或者双方反悔的，土地管理部门及时提出处理意见，报错处处理决定。
根据我国《土地管理法》的规定，宅基地纠纷的解决办法，主要有三种：
(1)协商解决
《土地管理法》第16条第1款规定：”土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决。“据此规定，公民之间发生的宅基地纠纷，应当先通过协商的方式加以解决。
(2)行政解决
《土地管理法》第16条第2款规定：”个人之间，个人与单位之间争议，由乡级或者县级以上处理。“该法还规定，侵犯土地的所有权或者使用权争议，由县级以上地方土地管理部门责令停止侵犯、赔偿损失。
(3)司法解决
《土地管理法》第16条第3款规定：”当事人对有关的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民起诉。这表明公民之间就土地的使用权和所有权发生的纠纷，只与按照《土地管理法》第16条和第53条的规定，先经过有关行政机关的处理，对于处理决定不服，才可以向人民提起诉讼。否则，人民不予受理。但对于侵犯土地的所有权或者使用权的，被侵权人可以不经行政机关的处理，而直接向人民起诉。
此外，宅基地纠纷还可以通过人民调解来解决。人民调解是指在调解委员会(包括城市的居民委员会和农村的村民委员会)的主持下，以国家的法律、法规规章、和社会公德为依据，对民间纠纷当事人进行说服教育、规劝疏导，促进纠纷当事人互相谅解，平等协商，从而自愿达成协议，消除纷争的一种群众自治活动。
结语
宅基地纠纷的解决办法有三种：协商、行政和司法解决。根据《土地管理法》规定，当事人应先通过协商解决纠纷，如协商不成，可向乡级或县级以上申请行政处理。对于侵犯土地所有权或使用权的纠纷，被侵权人可直接向人民提起诉讼。此外，人民调解也是一种解决纠纷的方式，通过调解委员会的协调，促进当事人和解，达成协议。在处理宅基地纠纷时，先进行调解是重要的一步，只有当调解无效时才考虑起诉。
法律依据
中华人民共和国农业法（2012修正）：第九章 农民权益保护 第七十一条 国家依法征收农民集体所有的土地，应当保护农民和农村集体经济组织的合法权益，依法给予农民和农村集体经济组织征地补偿，任何单位和个人不得截留、挪用征地补偿费用。
中华人民共和国农民专业合作社法（2017修订）：第八章 扶持措施 第六十 农民专业合作社从事农产品初加工用电执行农业生产用电价格，农民专业合作社生产性配套辅助设施用地按农用地管理，具体办法由有关部门规定。
中华人民共和国防沙治沙法（2018修正）：第五章 保障措施 第三十四条 使用已经沙化的国有土地从事治沙活动的，经县级以上依法批准，可以享有不超过七十年的土地使用权。具体年限和管理办法，由规定。
使用已经沙化的集体所有土地从事治沙活动的，治理者应当与土地所有人签订土地承包合同。具体承包期限和当事人的其他权利、义务由承包合同双方依法在土地承包合同中约定。县级依法根据土地承包合同向治理者颁发土地使用权证书，保护集体所有沙化土地治理者的土地使用权。