维普资讯 http://www.cqvip.com 国际检验医学杂志2007年11月第28卷箜 塑 !nI 望 : !! Q !! :垫! ・经验交流・ 鲍曼不动杆菌的基因分型及其应用 王苏建 虞丽娟 王家平 王仕忠 【摘要】 目的 运用重复片段引物PCR对鲍曼不动杆菌进行基因分型,了解鲍曼不动杆菌的基 因同源性。方法 选用肠杆菌科基因问的重复序列(ERIC)为引物进行PCR扩增,对24株鲍曼不动 杆菌进行分型,并与药敏结果进行比较。结果 用ERIC-PCR方法将鲍曼不动杆菌分为1O种基因 型,抗生素表型有4种。结论该方法简便易行,且重复性好。适合于医院流行病学研究。 【关键词】鲍曼不动杆菌; 基因分型; 多聚酶链反应 中图分类号:R378.99 文献标识码:B 文章编号:1673—4130(2007)11—1029 02 在非发酵菌中,不动杆菌在临床标本中的分离阳性率仅次 国临床实验室标准化委员会标准。(3)DNA制备:将菌株接种 于铜绿假单胞菌。不动杆菌为医院感染常见病原菌,该菌广泛 于肉汤培养基中,35℃培养24 h。取菌液300 l,12 000 r/min 存在于自然界、医院、人体皮肤、消化道及呼吸道内,是引起医 离心5 min,弃上清,沉淀物加生理盐水洗涤3次,弃上清。加 院感染的重要条件致病菌 ,其中最常见的是鲍曼不动杆 裂解液5O l,100。C煮沸15 min。12 000 r/min离心5 min,取 菌 ,日前多重耐药的鲍曼不动杆菌已成为医院感染的重要 上清2 l做为反应模板。(4)反应体系总体积25 l。其中引 病源菌,常引起呼吸道、尿道及伤口感染、脑膜炎、中耳炎和菌 物2 pl(0.2 pm)、DNA摸板2.0 l、10Xbuffer(Mg”)25 l、 血症等 。特别是重症监护病房内感染的暴发流行 ],因此 dNTPs 2.0 tlf(200 m)、Taq酶1O l、双蒸水15.5 l。(5)扩 对鲍曼不动杆菌的基因同源性研究具有重要的分子流行病学 增条件:94℃预变性5 min,后设94℃45 S、53℃45 s、72。C 1 意义。为了解我院鲍曼不动杆菌的基因同源性,我们采用肠杆 min 35次循环后72℃延伸6 min。(6)产物检测:取5 l扩增 菌科基因间重复序列PCR(enterbacteriat repetitive intergenic 产物,用1%琼脂糖电泳,溴化乙啶染色,主条带位置和数量相 consensus,ERIC—PCR)对临床分离的24株细菌基因组DNA 同为同一基因型。 进行了分型,现报道如下。 结 果 材料与方法 1.24株鲍曼不动杆菌药敏模式分型,见表1。 1.材料:(1)菌株:2005年9月~2006年3月从本院临床 表l 24株鲍曼不动杆菌药敏模式分型 患者痰液、尿液、分泌物中分离的24株鲍曼不动杆菌。质控菌 株:大肠埃希菌ATCC 25922。(2)药敏纸片:阿米卡星(丁)、 萘啶酸(萘)、氨曲南(南)、复方新诺明(复)、头孢噻吩(吩)、亚 胺培南(亚)、环丙沙星(环)、阿奇霉素(阿)、头孢吡肟(马)、头 孢孟多(孟)等1O种细菌药敏纸片,均由杭州天和微生物试剂 有限公司提供。(3)主要试剂根据文献[6]合成引物序列为 ERICI 3 CAC TTA GGG GTC CTC GAA TGT A 5 ERIC 2 3GCG AGT GGG GTC AGT GAA TCA A 5 、10 buffer 2.ERIC-PCR基因分型图谱,见图1。 (Mg )、缓冲液、dNTPs、Taq酶均由上海生工生物工程技术 服务有限公司提供,裂解液购于华美生物工程有限公司。(4) 主要仪器:法国Bio Merieux公司生产的Vitek.32型全自动细 菌培养鉴定仪;美国ABI公司生产的AB17000基因扩增仪;上 海复旦高科技有限公司生产的FX—BY一252型电泳仪;凝胶成 像系统为美国Bio Rad公司生产。 2.方法:(1)菌株鉴定:所有鲍曼不动杆菌经全自动细菌鉴 定和药敏试验系统(Vitek32)鉴定仪用革兰阴性杆菌鉴定卡鉴 定。(2)药敏实验用纸片扩散法(K B法)测定对阿米卡星、萘 啶酸、氨曲南、复方新诺明等抗生素的敏感性,结果测定参照美 图1 ERIC-PCR基因分型图谱 3.24株鲍曼不动杆菌抗生素敏感实验结果和ERIC-PCR分 作者单位:213003江苏省常州市第二人民医院检验科 型结果,见表2。 维普资讯 http://www.cqvip.com
・1030・ 垦 匿堂壅查2∞7年I1月第z8卷第11期Int J LabMed,November 2007,Vo1.28,No.11 表2 24株鲍曼不动杆菌抗生素敏感实验和 ERIC-PCR分型结果 讨 论 基因同源性分析的有效性因微生物种类的不同而存在差 异 ]。本文ERIC-PCR结果显示,24株鲍曼不动杆菌分为1O 种基因型,片段大多在50 ̄300 kb范围内。其中以A(8株)、B (6株)型为主。由表2可知ERIC—PCR的分辨力明显强于药 敏表型。另外,菌株表现型相同,基因型可以不同,基因型相 同,菌株表现型也可以不同。 目前,用于鲍曼不动杆菌同源性分析常用的方法有脉冲场 凝胶电泳、随机引物扩增DNA多态性和ERIC_PCR。脉冲场 凝胶电泳分辨力高,是目前细菌分型的金标准,但此设备价格 极为昂贵,一般实验室不具备;且此方法费时费力,故不易推 广 。.9]。 随机引物扩增DNA多态性虽然具有快速、简便、省时、省 力的优点,但它选择的引物短,在低温退火温度下与模板进行 随机扩增,因此产生的非特异性条带较多,影响结果;且该技术 尚未进行统一化和标准化,因而难以对不同实验室的结果以及 流行菌株特征进行比较。 ERIC是常用的一类引物,长度为126 bp,位于染色体上 非编码转录区,不同细菌ERIC在染色体上的位置不一样。所 以ERIC-PCR其分辨力较随机引物扩增DNA多态性强,与脉 冲场凝胶电泳具有相关性,结果可靠,是目前常用的简便、快速 的基因分型技术,同一对引物也适用于其他革兰阴性杆菌的分 型,适合于一般实验室常规开展。同时,对临床分离的同种菌 株进行分型,对于流行病学的调查、切断传染源和传播途径有 着重要的临床意义,有利于临床上判断是否暴发某种细菌感 染,从而及时采取相应措施阻止耐药菌进一步扩散。因此,在 医院流行病学调查与临床细菌分型中具有较好的应用前景。 参 考文 献 [1]张庆玲,刘明华,王仙园,等.泰能和氨苄西林/舒巴坦治疗鲍曼 不动杆菌感染的临床研究EJ].第三军医大学学报,2003,25(7): 632-634. E2]刘锡光,主编.现代诊断微生物学EM].北京:人民卫生出版社, 2002.436—462. [3]陈东科,彭红,张秀珍.医院内不动杆菌产酶耐药表型研究[J]. 临床检验杂志,2004,22(1):28—31. E 43 Carbonne A,Naas T,Blanckaert K。et a1.Investigation of a nos- ocomial outbreak of extended-spectrum beta-lactamase VEB-1一 producing isolates of Acinetobacter baumannii in a hospital settit ̄g EJ].J Hosp Infect,2005,60(1):14—18. E5]Jeon BC,Jeong SH,Bae IK,et a1.Investigation of a nosocomial outbreak of imipenem-resistant Acinetobacter baumannii produ— cing the OXA-23 beta-lactamase in koreaEJ].J Clin Microhiol, 2005,43(5):2241—2245. -16]夏云,张玉洪,曹何,等.应用重复PCR指纹技术调查肺科ICU 鲍曼不动杆菌的暴发流行EJ].陕西医学检验,2000,15(1):16— 18. E73 Cartelle M,del-Mar-Tomas M,Pertega S,et a1.Risk factors for colonization and infection in a hospital outbreak caused by a strain of Klebsiella pneumoniae with reduced susceptibility to expanded- spectrum eephalosporins[J].J Clin Microbiol,2004,42(9): 4242-4249. E8]Yoo JH,Choi JH,Shin WS,et a1.Application of infrequent—re— striction—site PCR to clinical isolates of Acinetobacter haumannii and Serratia marcescens[J].J Clin Microbiol,1999,37(10): 3108-31 12. [9]Su LH,Leu HS,Chiu YP,et a1.Molecular investigation of two clusters of hospital・’acquired bacteraemia caused by multi—。resistant Klebsiella pneumoniae using pulsed—field gel electrophoresis and in frequent restriction site PCR.Infection Control GroupEJ].J Hosp Infect,2000。46(2):110一ll7. (收稿日期:2007-02—14)